Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms