Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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USP35Q9P2H5 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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USP35Q9P2H5 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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USP35Q9P2H5 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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