Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms