Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms