Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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