Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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GGTLC3B5MD39 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
GGTLC3B5MD39 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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