Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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USP35Q9P2H5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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