Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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