Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSPP1Q1MSJ5 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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