Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TCOF1Q13428 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TCOF1Q13428 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TCOF1Q13428 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TCOF1Q13428 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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