Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMPOP42166 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms