Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRMD3A2A2Y4 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms