Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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