Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms