Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ETFRF1Q6IPR1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms