Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms