Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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