Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCLCP48506 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms