Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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