Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFNP31947 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFNP31947 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFNP31947 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms