Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARID4AP29374 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms