Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPN2P17655 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms