Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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