Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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