Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ZNF479Q96JC4 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms