Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms