Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IMPG1Q17R60 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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