Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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