Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms