Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALD1Q05682 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms