Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms