Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms