Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRP55822 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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