Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 RN7SL309P-201ENST00000491364 286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC104041.1-202ENST00000560097 566 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC02395-202ENST00000547443 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC009086.1-201ENST00000567219 309 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NESP48681 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 TXNRD3NB-201ENST00000404489 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AC091564.7-201ENST00000545572 464 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AC084064.1-201ENST00000569938 419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NESP48681 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AL137785.1-201ENST00000637466 490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NESP48681 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms