Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXA13P31271 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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