Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SYT1P21579 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SYT1P21579 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYT1P21579 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYT1P21579 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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