Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTMAP06454 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms