Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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