Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms