Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC3Q15034 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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