Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms