Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TXNRD3NB-201ENST00000404489 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms