Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 SEC14L2-201ENST00000402592 1229 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NESP48681 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AC073592.1-201ENST00000543970 1282 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AP002383.2-201ENST00000545768 675 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 NT5CP2-201ENST00000553305 561 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NESP48681 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NESP48681 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NESP48681 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NESP48681 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
NESP48681 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AC118553.1-201ENST00000454219 655 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NESP48681 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 IQCD-201ENST00000299732 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 AL157414.1-201ENST00000366097 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 PGAM1P2-201ENST00000436071 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 RN7SL313P-201ENST00000497618 288 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 DIO2-206ENST00000555750 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 PTPRT-212ENST00000620410 940 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NESP48681 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms