Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTGS1P23219 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms