Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms