Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MAP3K4Q9Y6R4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
MAP3K4Q9Y6R4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms