Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms