Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPRBQ9Y5M8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRPRBQ9Y5M8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms