Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD2APQ9Y5K6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD2APQ9Y5K6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms