Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB2Q9Y5E7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms